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Instabilité génomique et hémopathies humaines


MarseilleINSERM U1104
Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy

Thèmes de recherche & objectifs

Thèmes de recherche

Identification de biomarqueurs de progression et de nouvelles cibles thérapeutiques dans le lymphome et la leucémie aigue lymphoblastique.

Objectifs

Le laboratoire vise à identifier les altérations moléculaires « addictives » présentes dans les néoplasies lymphoïdes, et en particulier les mutations fondatrices des cellules précurseurs cancéreuses (CPC) responsables des rechutes/ rechutes précoces/résitance au traitement. L’équipe de recherche teste l’inhibition de ces cibles en modèles précliniques in vitro/ex vivo/in vivo « à la carte ».

Sous-types de lymphomes

- Lymphomes B dont folliculaire
- Leucémie aigüe lymphoblastique (LAL)

Expertise

Cibles biologiques et modèles in vitro/in vivo/ex vivo

Cibles
- Altérations moléculaires « addictives » des néoplasies lymphoïdes
- Signalisation BCR/TCR
- Mutations fondatrices des cellules précurseurs cancéreuses (CPC) responsables des rechutes
- c-MYC, PTEN, TAL1 dans le LAL-T
- Epigénétique

Modèles
- Lignées de cellules B et T (modification par CRISPR/Cas9)
- Modèles murins précliniques « à la carte » (KI/KO/Tg, rétrovirus conditionnels, BMT, immunisation chronique long-terme, transplantation de tumeur, PDX)
- Modèles murins mimant la progression du lymphome folliculaire (LF) précoce vers des structures équivalentes de LF in situ (FLIS)
- Modèles de xénogreffes LAL-T dans des souris immunodéficientes à partir de cellules primaires humaines
- Culture PDX ex vivo court terme pour le criblage de molécules

Biomarqueurs sanguins et tissulaires

Biomarqueurs de progression et de nouvelles cibles thérapeutiques dans le lymphome et la leucémie aigüe lymphoblastique

Technologies innovantes

- Lenti/Retro-viral manipulation & PDX
- NGS, OMICS (Attac-seq, ChiP-seq, RNA-seq, scRNA-seq, exome)
- Single-cell RNAseq / single-cell qPCR & pipelines bioinformatiques développés pour le single-cell
- CRISPR/CAS9 (editing lignées et CrispR/CAS screen)
- shRNA
- Chemogrammes
- FACS multicouleur

Plateformes & ressources techniques

- Single-cell RNAseq (10x Genomics Chromium)
- Single-cell qPCR (Fluidigm Biomark)
- Laboratoire de confinement L2/3 (CMF/tri cellulaire, plateau technique de production de lentivirus)
- Influx cell-sorter dédié en L2
- Imagerie (microscopie confocale/biphotonique)
- Ingénierie de la souris
- Collection de PDX transplantable, biologiquement caractérisé et cliniquement annoté de LAL-T

Offre de R&D

- Expertise néoplasies lymphoïdes
- Expertise technologie single-cell et pipelines d’analyse bioinformatique
- Expertise technologie CRISPR/CAS9
- Concept, design et modèles précliniques à la carte
- Collection PDX (LAL-T)

Mots clés

Lymphome folliculaire, LAL-T, Oncogenèse, Addiction oncogénique, CPC, Single-cell, -OMICS, CRISPR/CAS screen, Modèles précliniques, Biomarqueurs prédictifs et de pronostic

Téléchargez notre poster de présentation (en anglais) (.pdf)

Projets de l’unité