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Microenvironment Cell differentiation, iMmunology And Cancer (MICMAC)

Responsable : Karin Tarte

RennesUMR U1236

Thèmes de recherche & objectifs

Thèmes de recherche

Lymphomes B du centre germinatif :
- Etude de la différenciation des cellules B normales et tumorales du centre germinatif
- Etude de la niche tumorale du lymphome B

Objectifs

Le laboratoire vise à :
- identifier les mécanismes de l’interaction hôte/tumeur dans les lymphomes B
- en déduire des cibles thérapeutiques et des biomarqueurs potentiels.

Sous-types de lymphomes

- Lymphome folliculaire (LF)
- Lymphome diffus à grandes cellules B (LDGCB)

Expertise

Cibles biologiques et modèles in vitro/in vivo/ex vivo

Cibles
- Anticorps anti-CD137 et lymphomes
- CXCL12
- Cibles cellulaires (TFH, cellules stromales de soutien)

Modèles
- Modèle de différentiation in vitro de B naïfs normaux humains
- Modèles d’étude in vitro (cytométrie, microscopie, transcriptomique, études fonctionnelles) des interactions entre les lymphocytes B normaux et tumoraux et les acteurs du microenvironnement (cellules stromales, TFH, macrophages)
- Modèles murins xénogreffés de lymphome diffus à grandes cellules B
- Culture de cellules primaires avec tests fonctionnels
- Co-cultures cellules B primaires/stroma issu de sujets sains et de patients (survie, prolifération, résistance aux drogues…)
- Co-cultures cellules B/macrophages et PN (ADCP)

Biomarqueurs sanguins et tissulaires

Programme d’identification de biomarqueurs sanguins diagnostiques et pronostiques dans les LDGCB et les LF par des études transcriptomiques, protéomiques, phénotypiques et fonctionnelles.

Signaux pharmaco-dynamiques précoces d’activité

Plateforme d’immunomonitoring permettant un suivi standardisé (SOP) par cytométrie multicouleur et analyses fonctionnelles des patients traités par des approches thérapeutiques innovantes (dialogue DC-NK, activité Treg, activité IDO, caractérisation par CMF multicouleur des sous-populations T/B/myéloïdes/stromales…).

Outils, processus et plateformes en lien avec la recherche clinique

- Tumorothèque de lymphome incluant des échantillons congelés de cellules viables d’organes lymphoïdes et de moelle osseuse de patients et de sujets sains (CRB Lymphome de Rennes)
- Base de données clinico-biologiques (Programme Marguerite)
- Plateforme d’essais de phase I (CIC de Rennes)

Technologies innovantes

- ADCC
- Immunomonitoring multicouleur (cytométrie) standardisé d’études multicentriques (tests validés à J+1)
- Technique de capture de gènes
- miR-seq, RNA-seq, ATA-seq, ChIP-seq, methyl-seq
- Single-cell qPCR et SC-RNA-seq
- Mise en place culture 3D stroma/B

Plateformes & ressources techniques

- Plateforme d’essais de phase I (CIC de Rennes)
- Laboratoire d’immunomonitoring (SITI) : permettant des analyses multicentriques (core lab)
- Plateformes de la SFR BIOSIT : microscopie (Plateforme IBISA MRic http://microscopie.univ-rennes1.fr/), génomique (Plateforme IBISA Biogenouest de Rennes), laboratoire L3 (vecteurs lentiviraux), animalerie
- Capture de gènes : SureSelect-Agilent du laboratoire Hématologie du CHU de Rennes
 

Offre de R&D

Le laboratoire propose des projets collaboratifs sur :
- cocultures cellules B primaires/stroma issu de sujets sains et de patients (survie, prolifération, résistance aux drogues…)
- cocultures cellules B/macrophages et PN (ADCP)
- ADCC
- immunomonitoring multicouleur standardisé d’études multicentriques (tests validés à J+1)

Mots clés

Lymphome folliculaire, LDGCB, Hodgkin, Microenvironnement, Cellules stromales, TFH, Macrophages, Différentiation B normale et tumorale, Biomarqueurs sanguins, Epigénétique, Single-cell analysis, modèles murins, culture 3D

Téléchargez notre poster de présentation (en anglais) (.pdf)

Projets de l’unité