Développé depuis 2020 par l’équipe R&D de l’Institut Carnot CALYM, le Lymphoma Data Hub est un outil à disposition de toutes les entités membres du consortium. La force de cette nouvelle plateforme est sa capacité à exploiter un volume très important de données existantes. Il a été conçu initialement pour offrir aux chercheurs et médecins une plateforme de partage sécurisée et un traitement de données harmonisées, afin de pouvoir aller plus loin dans leurs analyses grâce à une solution full cloud.

Cette plateforme peut être déployée pour des projets académiques mais également partenariaux avec des industriels souhaitant collaborer avec des équipes académiques. Bien qu’initialement imaginé et développé pour les projets dans le domaine du lymphome, le LDH s’adresse désormais à tous les porteurs de projets de recherche scientifiques sans restriction sur le domaine de recherche.

Le LDH permet aux acteurs d’un projet de venir partager des données afin que celles-ci puissent être exploitées par d’autres parties prenantes du projet, sans que les données transitent sur des environnements tiers. Les données restent au sein de la plateforme et les différents intervenants (fournisseurs de données, médecins en charge de l’enrichissement des données, data scientist, etc.) travaillent directement sur le plateforme.

Le LDH est une plateforme hébergée dans un Cloud certifiée HDS. L’ensemble de l’architecture est pensée pour une isolation complète des données entre les différents projets.

En déposant vos données et les données de vos collègues dans le LDH, vous pourrez utiliser notre Datalake et ainsi les lier entre elles pour une exploitation collaborative facilitée !

Vous pouvez déposer vos données sur le LDH et permettre à vos collègues de les enrichir directement dans cet environnment sécurisé.

Par exemple si vous avez des scans de lames anapath et que vous désirez les faire annoter par votre collègue médecin en vue d’une utilisation par un modèle IA , le LDH est la solution !

De nombreux types de données différentes sont déposées sur le LDH notamment :

• Nifti (.nii)
• Sas (.sas7bcat)
• Sql (.sql)
• Image médicale au format Aperio (.svs)
• Variant Call Format (.vcf)
• Excel (.xls/.xlsx)
• Binary Alignment Map (.bam)
• CSV (.csv)
• Fichier DAT (.dat)
• DICOM (.dcm)
• Word (.docx)
• Fichier Fastq (.fastq)
• Fichier INI (.ini)
• Fichier MIRAX (.mrxs)
• Fichier NanoZoomer Digital Pathology Image (.ndpi)
• Fichier Nifti (.nii)
• Fichier Zip (.zip)

Afin de vous répondre au mieux, nous analyserons ensemble :

• Votre domaine de recherche scientifique, 
• Le type de données que vous souhaitez exploiter (Images, Tabulaires, …)
• La volumétrie de données prévisionnelle,
• Les enrichissements prévus sur ces données,
• Les types de valorisation que vous imaginez pour vos données (statistiques, Machine Learning, Deep Learning, …).

A partie des éléments que vous nous aurez communiqués, nous établirons une estimation des coûts associés à votre projet. En collaborant étroitement avec vous, nous prenons en compte les aspects techniques, les ressources nécessaires et les éventuels complexités afin de fournir une évaluation la plus détaillée possible. Cette estimation inclut l’analyse approfondie de vos exigences, des développements éventuels, de la durée du projet ainsi que des coûts liés aux ressources humaines et technologiques.

Notre objectif est de vous offrir une estimation transparente et précise, vous permettant de planifier votre projet en toute confiance. Celle-ci couvrira :

• Les coûts de préparation de la plateforme et d’évolution si nécessaire,
• Les coûts d’exploitation une fois le projet démarré.

Avant de lancer Pour réaliser votre projet,  nous définissons le cadre réglementaire ensemble :

• Gouvernance de la Donnée : partage et validation des politiques, procédures et structures de gouvernance pour garantir la gestion efficace, sécurisée et éthique des données tout au long de leur cycle de vie.
• Accords Contractuels : établissement d’accords contractuels clairs et détaillés, définissant les droits, les responsabilités et les obligations de toutes les parties impliquées dans la collecte, le traitement et le partage des données.
• Conformité Réglementaire : Assurance de la conformité aux réglementations en vigueur, telles que le RGPD, EDS ou d’autres normes spécifiques à votre secteur, afin de garantir le respect des normes légales et éthiques.

En fonction de vos besoins, Calym peut prendre en charge :

• Le pilotage de l’aspect LDH uniquement,
• Le pilotage complet du projet de recherche.

A l’issue du projet, et comme prévu dans le cadre de la gouvernance prévue dans le référentiel EDS, Calym assure le suivi dans le temps des données jusqu’à leur suppression.